《神奇宝贝》（Pocket Monsters）共分为关都地区石英联盟、橘子群岛橘子联盟、城都地区城都联盟三篇，其中城都联盟还包括了一小段漩涡列岛大赛的故事。在橘子群岛时，小刚留在内木研究所，换小建和小智、小霞一同旅行，直到城都联盟，才又由小刚回国。

真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？

91.01.10(木) 　　51 瞳の中へ 藤田朋子 沢向要士 　　52 もういちど 中井貴一 鷲尾いさ子 　　53 盗聴レシーバーの怪 真木蔵人 　　91.01.17(木) 　　54 時間よ止まれ 山本淳一 東　めぐみ 　　55 あの日に帰りたい 松尾貴史 村上里佳子 　　56 視線の町 林隆三 林美保 　　91.01.24(木) 　　57 忘れられたメス 平田満 上田耕一 　　58 留守番電話 仙道敦子 斉藤隆次 　　59 座敷わらし 永島敏行 　　91.01.31(木) 　　60 Ｕ・Ｆ・Ｏ 高橋ひとみ 　　61 テレフォンカード ribbon 　　62 プリズナー 高橋和也 竹中直人 　　91.02.07(木) 　　63 バカばっかりだ！ 佐野史郎 　　64 こけし谷 嶋田久作 石田ゆり子 　　65 さよなら蔵町キネマ 田村高廣 井出　薫 　　91.02.14(木) 　　66 黒魔術 高嶋政伸 増田未亜 　　67 廃校７番目の不思議 小林昭二 野村義男 　　68 峠の茶屋 伊藤かずえ 速見典子 　　91.02.21(木) 　　69 コレクター 田中律子 塩見三省 　　70 極楽鳥花 宅麻伸 裕木奈江 　　71 運命の赤い糸 中村繁之 長山洋子 　　91.02.28(木) 　　72 私じゃない 中島朋子 　　73 家族の肖像 友里千賀子 本田博太郎 　　74 モルモット 小堺一機 　　91.03.07(木) 　　75 コインランドリー 相楽晴子 竹内力 　　76 受験生 鶴田忍 豊川悦司 　　77 石田部長代理の災難 伊東四朗 　　91.03.14(木) 　　78 歩く死体 渡辺裕之 小宮孝奉 　　79 離れません つみきみほ 天宮　良 　　80 8時50分 桜田淳子 岸田今日子 　　91.03.21(木) 　　81 真夜中 植草克秀 安達祐実 　　82 鏡 風見しんご 相川恵里 　　83 ど忘れ 坂上香織 田嶋令子 　　91.04.11(木) 　　89 呪いの紙人形 菊池桃子 別所哲也 　　90 息子帰る 布施博 渡辺満里奈 　　91 占いセット 田中美佐子 中尾ミエ 　　91.04.18(木) 　　92 愛車物語 佐藤寛之 伊藤美紀 　　93 ライバル 佐藤浩市 高岡健二 　　94 ズンドコベロンチョ 草刈正雄 田山涼成 　　91.05.02(木) 　　95 言うことを聞く子 早見優 　　96 不眠症 ラ サール石井 　　97 目覚まし時計 南果歩 豊原功補 　　91.05.09(木) 　　98 目撃者 布川敏和 　　99 伝言板 有森也実 水谷あつし 　　100 女優 ジュディ･オング 長塚京三 　　91.05.16(木) 　　101 ルームメイト 畠田理恵 　　102 奇跡の子供 三田寛子 松金よね子 　　103 着せ替え人形 笑福亭鶴瓶 長谷川初範 　　91.05.30(木) 　　104 ３人死ぬ 露口茂 　　105 覆面 獣神サンダーライガー 　　106 切腹都市(ハラキリシティ) 鶴田真由 竹中直人 　　91.06.06(木) 　　107 シンデレラ 中島唱子 もたいまさこ 　　108 夢 世良公則 郷田ほづみ 　　109 秘密の花園 鶴見辰吾 大西結花 　　91.06.13(木) 　　110 ともだち 錦織一清 香川照之 　　111 心霊写真 千堂あきほ 松田洋治 　　112 ベビーシッター 浅香唯 　　91.06.20(木) 　　113 あの世への伝言メッセージ 吉村明宏 　　114 笑う女 榎木孝明 　　115 ユリコちゃん 河原崎長一郎 鹿島かんな 　　91.07.04(木) 　　116 100円の脳ミソ 勝俣州和 草薙幸二郎 　　117 タイムスクーター 高嶋政伸 石田ゆり子 　　118 我が家はどこだ？ 柄本明 大野紋香 　　91.07.25(木) 　　119 残像 宮川一郎太 　　120 嘘八百屋 西村知美 宮川一郎太 　　121 リフレイン 松崎しげる 　　91.08.01(木) 　　122 おれに関する噂 萩原流行 大輝ゆう 　　123 ボタン 伊武雅刀 　　124 つまらない男 中山仁 　　91.08.08(木) 　　125 この気持ち伝えて 高岡早紀 奈美悦子 　　126 １９×× 梶原真理子 石原良純 　　127 記憶の沼 若林麻由美 　　91.08.22(木) 　　128 ボロボロ 三田村邦彦 大島蓉子 　　129 大蒜(ニンニク) 榊原郁恵 　　130 棚 小林克也 佐野史郎 　　91.08.29(木) 　　131 ま・ば・た・き 阿部寛 横山めぐみ 　　132 告白パーティ 中山忍 河合美智子 　　133 パパは犯罪者 小倉久寛 　　91.09.05(木) 　　134 替え玉 　　135 人格改造ドリンク 蟹江敬三 ただのあつ子 　　136 仙人 金山一彦 范文雀 　　91.09.19(木) 　　137 整理癖 渡辺裕之 　　138 ビデオドラック 古村比呂 本田理沙 　　139 冗費節減 嶋大輔 渡辺典子 　　91.09.26(木) 　　140 長い1日 根津甚八 　　141 カラオケBOX 杉山彩子 井上彩名 　　142 もう酒ヤ・メ・タ！ 三宅裕司 武野功雄 　　91.10.17(木) 　　148 赤い雲 工藤夕貴 前田耕陽 　　149 耳鳴り 和久井映見 鶴見辰吾 　　150 真夜中のディスクジョッキー 西田ひかる 石丸謙二郎 　　91.10.24(木) 　　151 聞こえる 石黒賢 大森博 　　152 死にたくない 石田ひかり 片桐はいり 　　153 ボクの好きな先生 小林稔侍 鈴木ヒロミツ 　　91.10.31(木) 　　154 バイパスの夜 寺田農 　　155 STILL 大沢健 　　156 死神 そのまんま東 森山祐子 　　91.11.07(木) 　　157 未来の思い出 林家こぶ平 石田ゆり子 　　158 ボールペン 桜井幸子 中山雅巳 　　159 みどり紙 薬丸裕英 原田貴和子 　　91.11.14(木) 　　160 無人艦隊 永島敏行 伊東達広 　　161 あやしい鏡 南野陽子 千波丈太郎 　　162 驚異の降霊術 柴俊夫 玉川良一 　　91.11.21(木) 　　163 前世の恐怖 近藤正臣 姿　晴香 　　164 3日間だけのエース 森且行 松岡昌宏 　　165 そこでは、お静かに 藤真利子 　　91.11.28(木) 　　166 シガレット・ボム！ 保坂尚輝 渡辺由紀 　　167 悲鳴 佐藤浩市 　　168 行列 世良公則 　　91.12.05(木) 　　169 チャネリング 佐藤Ｂ作 沖直美 　　170 毛皮が脱げない 畠田理恵 銀粉蝶 　　171 海亀のスープ 木内みどり いかりや長介 　　91.12.12(木) 　　172 ホームドラマ 松原千明 田山涼成 　　173 まだ恋は始まらない 大滝秀治 風見章子 　　174 佐藤・求む 平田満 佐藤幸雄 　　91.12.19(木) 　　175 神様 ポール牧 　　176 ハネムーン 高木美保 　　177 もうひとり 風間杜夫 桜金造

91.01.10(木) 　　51 瞳の中へ 藤田朋子 沢向要士 　　52 もういちど 中井貴一 鷲尾いさ子 　　53 盗聴レシーバーの怪 真木蔵人 　　91.01.17(木) 　　54 時間よ止まれ 山本淳一 東　めぐみ 　　55 あの日に帰りたい 松尾貴史 村上里佳子 　　56 視線の町 林隆三 林美保 　　91.01.24(木) 　　57 忘れられたメス 平田満 上田耕一 　　58 留守番電話 仙道敦子 斉藤隆次 　　59 座敷わらし 永島敏行 　　91.01.31(木) 　　60 Ｕ・Ｆ・Ｏ 高橋ひとみ 　　61 テレフォンカード ribbon 　　62 プリズナー 高橋和也 竹中直人 　　91.02.07(木) 　　63 バカばっかりだ！ 佐野史郎 　　64 こけし谷 嶋田久作 石田ゆり子 　　65 さよなら蔵町キネマ 田村高廣 井出　薫 　　91.02.14(木) 　　66 黒魔術 高嶋政伸 増田未亜 　　67 廃校７番目の不思議 小林昭二 野村義男 　　68 峠の茶屋 伊藤かずえ 速見典子 　　91.02.21(木) 　　69 コレクター 田中律子 塩見三省 　　70 極楽鳥花 宅麻伸 裕木奈江 　　71 運命の赤い糸 中村繁之 長山洋子 　　91.02.28(木) 　　72 私じゃない 中島朋子 　　73 家族の肖像 友里千賀子 本田博太郎 　　74 モルモット 小堺一機 　　91.03.07(木) 　　75 コインランドリー 相楽晴子 竹内力 　　76 受験生 鶴田忍 豊川悦司 　　77 石田部長代理の災難 伊東四朗 　　91.03.14(木) 　　78 歩く死体 渡辺裕之 小宮孝奉 　　79 離れません つみきみほ 天宮　良 　　80 8時50分 桜田淳子 岸田今日子 　　91.03.21(木) 　　81 真夜中 植草克秀 安達祐実 　　82 鏡 風見しんご 相川恵里 　　83 ど忘れ 坂上香織 田嶋令子 　　91.04.11(木) 　　89 呪いの紙人形 菊池桃子 別所哲也 　　90 息子帰る 布施博 渡辺満里奈 　　91 占いセット 田中美佐子 中尾ミエ 　　91.04.18(木) 　　92 愛車物語 佐藤寛之 伊藤美紀 　　93 ライバル 佐藤浩市 高岡健二 　　94 ズンドコベロンチョ 草刈正雄 田山涼成 　　91.05.02(木) 　　95 言うことを聞く子 早見優 　　96 不眠症 ラ サール石井 　　97 目覚まし時計 南果歩 豊原功補 　　91.05.09(木) 　　98 目撃者 布川敏和 　　99 伝言板 有森也実 水谷あつし 　　100 女優 ジュディ･オング 長塚京三 　　91.05.16(木) 　　101 ルームメイト 畠田理恵 　　102 奇跡の子供 三田寛子 松金よね子 　　103 着せ替え人形 笑福亭鶴瓶 長谷川初範 　　91.05.30(木) 　　104 ３人死ぬ 露口茂 　　105 覆面 獣神サンダーライガー 　　106 切腹都市(ハラキリシティ) 鶴田真由 竹中直人 　　91.06.06(木) 　　107 シンデレラ 中島唱子 もたいまさこ 　　108 夢 世良公則 郷田ほづみ 　　109 秘密の花園 鶴見辰吾 大西結花 　　91.06.13(木) 　　110 ともだち 錦織一清 香川照之 　　111 心霊写真 千堂あきほ 松田洋治 　　112 ベビーシッター 浅香唯 　　91.06.20(木) 　　113 あの世への伝言メッセージ 吉村明宏 　　114 笑う女 榎木孝明 　　115 ユリコちゃん 河原崎長一郎 鹿島かんな 　　91.07.04(木) 　　116 100円の脳ミソ 勝俣州和 草薙幸二郎 　　117 タイムスクーター 高嶋政伸 石田ゆり子 　　118 我が家はどこだ？ 柄本明 大野紋香 　　91.07.25(木) 　　119 残像 宮川一郎太 　　120 嘘八百屋 西村知美 宮川一郎太 　　121 リフレイン 松崎しげる 　　91.08.01(木) 　　122 おれに関する噂 萩原流行 大輝ゆう 　　123 ボタン 伊武雅刀 　　124 つまらない男 中山仁 　　91.08.08(木) 　　125 この気持ち伝えて 高岡早紀 奈美悦子 　　126 １９×× 梶原真理子 石原良純 　　127 記憶の沼 若林麻由美 　　91.08.22(木) 　　128 ボロボロ 三田村邦彦 大島蓉子 　　129 大蒜(ニンニク) 榊原郁恵 　　130 棚 小林克也 佐野史郎 　　91.08.29(木) 　　131 ま・ば・た・き 阿部寛 横山めぐみ 　　132 告白パーティ 中山忍 河合美智子 　　133 パパは犯罪者 小倉久寛 　　91.09.05(木) 　　134 替え玉 　　135 人格改造ドリンク 蟹江敬三 ただのあつ子 　　136 仙人 金山一彦 范文雀 　　91.09.19(木) 　　137 整理癖 渡辺裕之 　　138 ビデオドラック 古村比呂 本田理沙 　　139 冗費節減 嶋大輔 渡辺典子 　　91.09.26(木) 　　140 長い1日 根津甚八 　　141 カラオケBOX 杉山彩子 井上彩名 　　142 もう酒ヤ・メ・タ！ 三宅裕司 武野功雄 　　91.10.17(木) 　　148 赤い雲 工藤夕貴 前田耕陽 　　149 耳鳴り 和久井映見 鶴見辰吾 　　150 真夜中のディスクジョッキー 西田ひかる 石丸謙二郎 　　91.10.24(木) 　　151 聞こえる 石黒賢 大森博 　　152 死にたくない 石田ひかり 片桐はいり 　　153 ボクの好きな先生 小林稔侍 鈴木ヒロミツ 　　91.10.31(木) 　　154 バイパスの夜 寺田農 　　155 STILL 大沢健 　　156 死神 そのまんま東 森山祐子 　　91.11.07(木) 　　157 未来の思い出 林家こぶ平 石田ゆり子 　　158 ボールペン 桜井幸子 中山雅巳 　　159 みどり紙 薬丸裕英 原田貴和子 　　91.11.14(木) 　　160 無人艦隊 永島敏行 伊東達広 　　161 あやしい鏡 南野陽子 千波丈太郎 　　162 驚異の降霊術 柴俊夫 玉川良一 　　91.11.21(木) 　　163 前世の恐怖 近藤正臣 姿　晴香 　　164 3日間だけのエース 森且行 松岡昌宏 　　165 そこでは、お静かに 藤真利子 　　91.11.28(木) 　　166 シガレット・ボム！ 保坂尚輝 渡辺由紀 　　167 悲鳴 佐藤浩市 　　168 行列 世良公則 　　91.12.05(木) 　　169 チャネリング 佐藤Ｂ作 沖直美 　　170 毛皮が脱げない 畠田理恵 銀粉蝶 　　171 海亀のスープ 木内みどり いかりや長介 　　91.12.12(木) 　　172 ホームドラマ 松原千明 田山涼成 　　173 まだ恋は始まらない 大滝秀治 風見章子 　　174 佐藤・求む 平田満 佐藤幸雄 　　91.12.19(木) 　　175 神様 ポール牧 　　176 ハネムーン 高木美保 　　177 もうひとり 風間杜夫 桜金造

作品主要讲述了学习十分认真刻苦的男高中生丸尾荣一郎，为了解决自身运动不足的问题而参加了STC(南网球俱乐部)的免费体验。在那里遇到了之前借笔记的隔壁班的鹰崎奈津，通过与她的对话，荣一郎正式开始练习打网球。慢慢地，他不仅喜欢上了网球，而且也更加了解网球。

小智和皮卡丘来到了新的舞台丰缘地方。那里有未知的宝可梦和尚不了解对手的战斗。在那里，他们邂逅了小遥和小胜姐弟。小遥的目标是成为顶级宝可梦协调训…

日本人气动画《宠物小精灵》第17部全新剧场版《Pokemon the movie XY破坏之茧》（导演：汤山邦彦）决定将于2014年7月在日本公映。此部全新剧场版取消了以…

小智、小霞、小健及皮卡丘一行人来到了橘子群岛，在路途上遇到了暴风雨把他们吹到了亚西亚岛上，来到这里刚好村民在举行祭典，在祭典上小智从芙萝拉的口中听到一个古老的传说，“火之神、雷之神、冰之神不可以擅自触及，否则天地的愤怒将令世界走向灭亡”。这时坏人为了达到自己的目标抓洛奇亚，不惜破坏这个古老的传说，在祭典上芙萝拉要小智成为拯救世界的人，但必须得到三样宝物，这三样宝物分别在火之岛、雷之岛、冰之岛。小智去火之岛的路途中却遇到暴风雨，这时候，芙萝拉认为是她让小智走向危险的地方，所以芙萝拉、小霞、小健就决定去找小智．这时在火之岛的小智与皮卡丘要离开时遇到火箭队，而就在火箭队要强夺皮卡丘时，芙萝拉一行人刚好来到。芙萝拉与小智说话的同时，闪电鸟出现在火之岛，就在皮卡丘用它的电击与闪电鸟说话时，坏人出现了，它把闪电鸟的能源吸收后就抓了闪电鸟，连同小智一行人也被抓了。到底小智等人会如何呢？

小智、小霞、小健及皮卡丘一行人来到了橘子群岛，在路途上遇到了暴风雨把他们吹到了亚西亚岛上，来到这里刚好村民在举行祭典，在祭典上小智从芙萝拉的口中听到一个古老的传说，“火之神、雷之神、冰之神不可以擅自触及，否则天地的愤怒将令世界走向灭亡”。这时坏人为了达到自己的目标抓洛奇亚，不惜破坏这个古老的传说，在祭典上芙萝拉要小智成为拯救世界的人，但必须得到三样宝物，这三样宝物分别在火之岛、雷之岛、冰之岛。小智去火之岛的路途中却遇到暴风雨，这时候，芙萝拉认为是她让小智走向危险的地方，所以芙萝拉、小霞、小健就决定去找小智．这时在火之岛的小智与皮卡丘要离开时遇到火箭队，而就在火箭队要强夺皮卡丘时，芙萝拉一行人刚好来到。芙萝拉与小智说话的同时，闪电鸟出现在火之岛，就在皮卡丘用它的电击与闪电鸟说话时，坏人出现了，它把闪电鸟的能源吸收后就抓了闪电鸟，连同小智一行人也被抓了。到底小智等人会如何呢？

《呼噜小精灵第二季》接着讲述来自睡不醒王国的呼噜小精灵和男孩可乐之间发生的故事。